Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFMP43652 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFMP43652 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFMP43652 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFMP43652 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFMP43652 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFMP43652 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFMP43652 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFMP43652 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFMP43652 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AFMP43652 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AFMP43652 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFMP43652 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms