Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR1P43307 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR1P43307 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR1P43307 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR1P43307 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSR1P43307 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR1P43307 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms