Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCAMP43121 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCAMP43121 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCAMP43121 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MCAMP43121 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCAMP43121 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCAMP43121 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCAMP43121 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCAMP43121 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCAMP43121 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCAMP43121 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCAMP43121 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCAMP43121 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCAMP43121 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCAMP43121 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCAMP43121 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCAMP43121 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCAMP43121 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms