Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CAP42336 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms