Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.66□□□□□ -1.82
PDR11P40550 PHD1YKL043W 1101 nt3.66□□□□□ -1.82
PDR11P40550 YAR070CYAR070C 300 nt3.66□□□□□ -1.82
PDR11P40550 TFC4YGR047C 3078 nt3.66□□□□□ -1.82
PDR11P40550 PMS1YNL082W 2622 nt3.65□□□□□ -1.82
PDR11P40550 YER133W-AYER133W-A 342 nt3.65□□□□□ -1.83
PDR11P40550 TGL1YKL140W 1647 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 RAD55YDR076W 1221 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 EMC6YLL014W 327 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 ICY1YMR195W 384 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 MRPS9YBR146W 837 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 KAR4YCL055W 1008 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 ATG1YGL180W 2694 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 STP2YHR006W 1626 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 TDA11YHR159W 1515 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 URK1YNR012W 1506 nt3.64□□□□□ -1.83
PDR11P40550 KTR6YPL053C 1341 nt3.63□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YIP5YGL161C 933 nt3.63□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YKR033CYKR033C 426 nt3.63□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YGK3YOL128C 1128 nt3.63□□□□□ -1.83
PDR11P40550 XRN1YGL173C 4587 nt3.63□□□□□ -1.83
PDR11P40550 UBP14YBR058C 2346 nt3.63□□□□□ -1.83
PDR11P40550 PEX1YKL197C 3132 nt3.62□□□□□ -1.83
PDR11P40550 RPL20BYOR312C 519 nt3.62□□□□□ -1.83
PDR11P40550 NCE102YPR149W 522 nt3.62□□□□□ -1.83
PDR11P40550 SGS1YMR190C 4344 nt3.62□□□□□ -1.83
PDR11P40550 AXL1YPR122W 3627 nt3.62□□□□□ -1.83
PDR11P40550 GCN1YGL195W 8019 nt3.62□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YDR491CYDR491C 492 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YHR213WYHR213W 597 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 RMA1YKL132C 1293 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YAR062WYAR062W 597 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 SSY1YDR160W 2559 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 SRC1YML034W 2505 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 GIN4YDR507C 3429 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 VPS33YLR396C 2076 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 ATP12YJL180C 978 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YAL037WYAL037W 804 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 PPA2YMR267W 933 nt3.61□□□□□ -1.83
PDR11P40550 SCM4YGR049W 564 nt3.6□□□□□ -1.83
PDR11P40550 YJU2YKL095W 837 nt3.6□□□□□ -1.83
PDR11P40550 RPB8YOR224C 441 nt3.6□□□□□ -1.83
PDR11P40550 RTT10YPL183C 3042 nt3.59□□□□□ -1.83
PDR11P40550 SEC26YDR238C 2922 nt3.59□□□□□ -1.83
PDR11P40550 NAB3YPL190C 2409 nt3.59□□□□□ -1.83
PDR11P40550 ECO1YFR027W 846 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 USE1YGL098W 738 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 PTI1YGR156W 1278 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 SEC14YMR079W 915 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 ECM2YBR065C 1095 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 HUL4YJR036C 2679 nt3.59□□□□□ -1.84
PDR11P40550 PRM7YDL039C 2097 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YHR177WYHR177W 1362 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 GRX6YDL010W 696 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 PAU14YIL176C 363 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 SFH5YJL145W 885 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 PAU1YJL223C 363 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YLR036CYLR036C 612 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 RPN13YLR421C 471 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 MCA1YOR197W 1299 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 RIB5YBR256C 717 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 CEP3YMR168C 1827 nt3.58□□□□□ -1.84
PDR11P40550 BAR1YIL015W 1764 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 DAP2YHR028C 2457 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 NVJ1YHR195W 966 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YLR125WYLR125W 411 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YLR255CYLR255C 354 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YPL014WYPL014W 1146 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YBR116CYBR116C 528 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 UBP15YMR304W 3693 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 STU1YBL034C 4542 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 KRE5YOR336W 4098 nt3.57□□□□□ -1.84
PDR11P40550 VAC17YCL063W 1272 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YDR401WYDR401W 564 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 RPL24BYGR148C 468 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 GRE3YHR104W 984 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YBR139WYBR139W 1527 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 MAL12YGR292W 1755 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 MAL32YBR299W 1755 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 VTC3YPL019C 2508 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 HAA1YPR008W 2085 nt3.56□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YCR101CYCR101C 549 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 AAD16YFL057C 459 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 SRB5YGR104C 924 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 SWP1YMR149W 861 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 PRE2YPR103W 864 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 BCK1YJL095W 4437 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 GAS5YOL030W 1455 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 OSH2YDL019C 3852 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 YGR067CYGR067C 2415 nt3.55□□□□□ -1.84
PDR11P40550 FKS3YMR306W 5358 nt3.54□□□□□ -1.84
PDR11P40550 AIM22YJL046W 1230 nt3.54□□□□□ -1.84
PDR11P40550 MSS116YDR194C 1995 nt3.54□□□□□ -1.84
PDR11P40550 ATG23YLR431C 1362 nt3.53□□□□□ -1.84
PDR11P40550 BET3YKR068C 582 nt3.53□□□□□ -1.84
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