Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTRLP40313 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 742.1 ms