Protein–RNA interactions for Protein: P38192

RRT1, Regulator of rDNA transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1P38192 MUP3YHL036W 1641 nt2.59□□□□□ -1.99
RRT1P38192 PEX1YKL197C 3132 nt2.59□□□□□ -2
RRT1P38192 EXO5YBR163W 1758 nt2.59□□□□□ -2
RRT1P38192 SEA4YBL104C 3117 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 MGT1YDL200C 567 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 HAT2YEL056W 1206 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 ERV29YGR284C 933 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 SKG1YKR100C 1068 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 TVP18YMR071C 504 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 ULP1YPL020C 1866 nt2.58□□□□□ -2
RRT1P38192 OAF3YKR064W 2592 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 MIC60YKR016W 1623 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 TSR1YDL060W 2367 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 YDR249CYDR249C 1122 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 PHO92YDR374C 921 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 VFA1YER128W 612 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 NCE103YNL036W 666 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 IZH2YOL002C 954 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 RRP36YOR287C 903 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 CMK1YFR014C 1341 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 SUP45YBR143C 1314 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 YDL176WYDL176W 2127 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 GAT2YMR136W 1683 nt2.57□□□□□ -2
RRT1P38192 MDM38YOL027C 1722 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 BAR1YIL015W 1764 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 FLO5YHR211W 3228 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 SDT1YGL224C 843 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 TTI2YJR136C 1266 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 ERP1YAR002C-A 660 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 RPC34YNR003C 954 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 CPR8YNR028W 927 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 CNS1YBR155W 1158 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 HFD1YMR110C 1599 nt2.56□□□□□ -2
RRT1P38192 ATG26YLR189C 3597 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 RRP17YDR412W 708 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 MIG1YGL035C 1515 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 YGR273CYGR273C 525 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 SKN7YHR206W 1869 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 ARP4YJL081C 1470 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 MBR1YKL093W 1020 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 YMR084WYMR084W 789 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 TOP1YOL006C 2310 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 NDJ1YOL104C 1059 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 MET16YPR167C 786 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 OPY1YBR129C 987 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 SET1YHR119W 3243 nt2.55□□□□□ -2
RRT1P38192 APN2YBL019W 1563 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 SHQ1YIL104C 1524 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 PUS9YDL036C 1389 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 SIZ1YDR409W 2715 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 WBP1YEL002C 1293 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 LIF1YGL090W 1266 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 USE1YGL098W 738 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 YKE4YIL023C 1041 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 VAM10YOR068C 345 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 NIP7YPL211W 546 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 MRPL51YPR100W 423 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 YMR317WYMR317W 3423 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 YVC1YOR087W 2028 nt2.54□□□□□ -2
RRT1P38192 MEK1YOR351C 1494 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 PHO5YBR093C 1404 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 CHO2YGR157W 2610 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 FRQ1YDR373W 573 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 RPB7YDR404C 516 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 STE14YDR410C 720 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 RPL30YGL030W 318 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 YJL028WYJL028W 336 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 MTR2YKL186C 555 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 OCA2YNL056W 594 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 YOR238WYOR238W 912 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 CUE3YGL110C 1875 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 SQS1YNL224C 2304 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 TOM1YDR457W 9807 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 DSN1YIR010W 1731 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 XRN1YGL173C 4587 nt2.53□□□□□ -2
RRT1P38192 STP1YDR463W 1560 nt2.53□□□□□ -2.01
RRT1P38192 PCI8YIL071C 1335 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 FLO9YAL063C 3969 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 SWI1YPL016W 3945 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 RPS14AYCR031C 414 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 DOG2YHR043C 741 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 YJR111CYJR111C 852 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 RRG9YNL213C 645 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 RPS7AYOR096W 573 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 TMA16YOR252W 537 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 HUT1YPL244C 1020 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 MCM16YPR046W 546 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 FES1YBR101C 873 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.52□□□□□ -2.01
RRT1P38192 VTC4YJL012C 2166 nt2.51□□□□□ -2.01
RRT1P38192 BPT1YLL015W 4680 nt2.51□□□□□ -2.01
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