Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACVR1BP36896 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACVR1BP36896 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms