Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHRNA7P36544 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA7P36544 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms