Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHKAP35790 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHKAP35790 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHKAP35790 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHKAP35790 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHKAP35790 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHKAP35790 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms