Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN4AP35499 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN4AP35499 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN4AP35499 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN4AP35499 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4AP35499 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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