Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD12P35452 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms