Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD11P31277 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms