Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXA10P31260 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXA10P31260 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXA10P31260 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms