Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NMBRP28336 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMBRP28336 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMBRP28336 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMBRP28336 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMBRP28336 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMBRP28336 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMBRP28336 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NMBRP28336 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMBRP28336 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBRP28336 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBRP28336 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBRP28336 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBRP28336 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NMBRP28336 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMBRP28336 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMBRP28336 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMBRP28336 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBRP28336 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBRP28336 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBRP28336 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMBRP28336 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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