Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms