Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YY1P25490 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YY1P25490 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YY1P25490 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YY1P25490 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
YY1P25490 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YY1P25490 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
YY1P25490 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YY1P25490 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YY1P25490 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YY1P25490 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YY1P25490 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YY1P25490 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
YY1P25490 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YY1P25490 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
YY1P25490 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
YY1P25490 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
YY1P25490 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YY1P25490 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YY1P25490 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YY1P25490 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YY1P25490 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
YY1P25490 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YY1P25490 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YY1P25490 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
YY1P25490 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms