Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM3P25205 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM3P25205 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCM3P25205 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCM3P25205 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM3P25205 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM3P25205 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM3P25205 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCM3P25205 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCM3P25205 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM3P25205 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM3P25205 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms