Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF4BP23588 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF4BP23588 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms