Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRGP23470 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms