Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPREP23469 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPREP23469 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPREP23469 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPREP23469 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPREP23469 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPREP23469 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms