Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX1P22670 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX1P22670 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX1P22670 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX1P22670 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX1P22670 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX1P22670 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX1P22670 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms