Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGFR4P22455 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR4P22455 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR4P22455 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms