Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA3P22001 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNA3P22001 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms