Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD247P20963 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD247P20963 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD247P20963 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD247P20963 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD247P20963 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD247P20963 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms