Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB5AP20339 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms