Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms