Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDSP20132 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDSP20132 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDSP20132 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDSP20132 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SDSP20132 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SDSP20132 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDSP20132 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDSP20132 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDSP20132 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDSP20132 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDSP20132 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDSP20132 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDSP20132 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SDSP20132 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SDSP20132 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SDSP20132 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SDSP20132 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SDSP20132 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms