Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EGR1P18146 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EGR1P18146 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EGR1P18146 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR1P18146 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR1P18146 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR1P18146 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EGR1P18146 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR1P18146 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms