Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PFKLP17858 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PFKLP17858 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFKLP17858 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFKLP17858 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFKLP17858 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PFKLP17858 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PFKLP17858 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFKLP17858 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFKLP17858 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFKLP17858 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFKLP17858 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFKLP17858 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFKLP17858 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFKLP17858 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFKLP17858 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms