Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN2P17655 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN2P17655 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms