Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXB4P17483 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB4P17483 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms