Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCF3P15923 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCF3P15923 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF3P15923 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF3P15923 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF3P15923 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF3P15923 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF3P15923 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF3P15923 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF3P15923 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF3P15923 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms