Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF2P15336 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF2P15336 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF2P15336 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF2P15336 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF2P15336 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF2P15336 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF2P15336 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF2P15336 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF2P15336 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF2P15336 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF2P15336 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF2P15336 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF2P15336 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms