Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAFP15056 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAFP15056 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAFP15056 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAFP15056 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAFP15056 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAFP15056 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAFP15056 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAFP15056 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms