Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNT1P13805 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT1P13805 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT1P13805 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms