Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-EP13747 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms