Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFTRP13569 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFTRP13569 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFTRP13569 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFTRP13569 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CFTRP13569 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CFTRP13569 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFTRP13569 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFTRP13569 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFTRP13569 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFTRP13569 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CFTRP13569 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFTRP13569 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFTRP13569 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CFTRP13569 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFTRP13569 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFTRP13569 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFTRP13569 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFTRP13569 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CFTRP13569 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFTRP13569 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFTRP13569 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFTRP13569 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CFTRP13569 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFTRP13569 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFTRP13569 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFTRP13569 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFTRP13569 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFTRP13569 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFTRP13569 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFTRP13569 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFTRP13569 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFTRP13569 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CFTRP13569 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFTRP13569 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFTRP13569 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFTRP13569 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFTRP13569 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFTRP13569 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFTRP13569 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms