Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTN1P12814 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTN1P12814 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms