Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIP12755 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIP12755 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIP12755 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIP12755 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIP12755 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKIP12755 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKIP12755 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKIP12755 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms