Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP3P12645 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMP3P12645 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP3P12645 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP3P12645 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP3P12645 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms