Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GZMAP12544 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GZMAP12544 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GZMAP12544 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GZMAP12544 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GZMAP12544 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GZMAP12544 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GZMAP12544 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GZMAP12544 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GZMAP12544 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GZMAP12544 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GZMAP12544 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GZMAP12544 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms