Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COX6A1P12074 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COX6A1P12074 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms