Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC192P0DO97 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms