Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGA3P0DJD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms