Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM228BP0C875 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms