Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
POLA1P09884 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
POLA1P09884 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
POLA1P09884 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
POLA1P09884 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLA1P09884 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLA1P09884 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
POLA1P09884 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLA1P09884 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLA1P09884 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLA1P09884 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
POLA1P09884 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
POLA1P09884 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
POLA1P09884 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
POLA1P09884 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
POLA1P09884 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
POLA1P09884 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
POLA1P09884 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
POLA1P09884 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
POLA1P09884 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
POLA1P09884 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLA1P09884 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLA1P09884 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLA1P09884 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLA1P09884 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
POLA1P09884 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
POLA1P09884 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
POLA1P09884 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
POLA1P09884 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
POLA1P09884 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
POLA1P09884 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLA1P09884 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLA1P09884 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
POLA1P09884 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms