Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT7P08729 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT7P08729 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT7P08729 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT7P08729 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT7P08729 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT7P08729 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms