Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB1P08238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB1P08238 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms