Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLI1P08151 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLI1P08151 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI1P08151 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLI1P08151 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLI1P08151 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLI1P08151 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI1P08151 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI1P08151 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI1P08151 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI1P08151 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI1P08151 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLI1P08151 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI1P08151 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI1P08151 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI1P08151 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI1P08151 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI1P08151 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms